Не надо в долях. Просто в браке достаточно. И это существенное уточнение, если вопрос касается ипотеки.
Если не в долях то покупатель у квартиры один и именно он получает вычет. Когда купит второй супруг квартиру он и получит свой вычет на стоимость покупки не более 2 000 000