Поясни, пожалуйста - не понял.
Раньше так мебель и собирали.
Сначала сверлили одну деталь с торца, в отверстия вставляли маркеры (центрА) и "накалывали" на другую деталь. Затем по отметкам рассверливали нужным диаметром и соединяли с помощью шкантов. Примерно так:

Только желательно начать установку шкантов с плоскости, а в торец по глубине можно с запасом засверлиться. В противном случае глубину сверления придётся высчитывать до миллиметра, чтоб не ушли шканты а детали плотно сели.
Центра вот такие:

Бывают разного диаметра и продаются даже в Кастораме.(рядом с фрезами комплектом из 4-х шт)
А установленные ящики нужны для того, чтобы после крепления крышки они могли нормально функционировать. Ведь боковые стойки спереди у тебя "в свободном плавании".
При отсутствии ящиков во время накалывания можно использовать обрезок ДСП как распорку, или большего размера полосу ДВП, временно прибитую сверху.